【基因检测，人人可及】基因检测百问百答之EGFR检测
本帖最后由 基因检测小助手 于 2023-9-11 13:27 编辑上篇从技术层面介绍了肿瘤基因变异检测的各种方法以及优劣势，大家可能觉得理论知识枯燥乏味，但相信大家更关心的各种检测方法能否准确地检测出各种基因变异类型，因为准确的检出肿瘤存在的基因变异才能使患者最大程度的获益。接下来将以非小细胞肺癌为例，就指南推荐的9个基因（EGFR,ALK,KRAS,ROS1,RET,MET,BRAF,HER2,NTRK）的突变类型及检测方法分别进行详细阐述，以期能够帮助大家正确认识基因检测技术以及选择检测套餐,本篇请看EGFR基因篇。
EGFR基因
表皮生长因子受体(EGFR)基因突变是东亚人群中非小细胞肺癌(NSCLC)最常见的驱动基因突变，发生率为40%～60%。目前，EGFR-TKI靶向单药治疗是EGFR基因突变局部晚期或转移NSCLC患者的标准治疗方案，以及奥希替应用于术后辅助治疗。
EGFR基因突变检测什么？
EGFR基因突变主要发生在胞内酪氨酸激酶TK 区域的18~21号外显子，目前发现的TK 区域突变有30多种。EGFR中最常见的经典突变约占90%（19del，L858R 点突变），EGFR少见突变约占10%（L861Q、G719X、S768I），以上敏感突变可从EGFR-TKI靶向治疗获益。此外，20外显子插入突变约占EGFR突变的12%，异质性强，亚型达100多种，且不同插入位点亚型临床获益不同，患者预后差，EGFR ex20ins突变的NSCLC患者中，传统的EGFR-TKIs仅对极少数（约占EGFR ex20ins突变的5.1%）的亚型有效例如A763_Y764insFQEA和A763_Y764insLQEA，而对其他大部分的亚型原发性耐药，疗效不佳，但目前获批的靶药莫博赛替尼和舒沃替尼是可以获益的。因此，准确检测EGFR基因突变是决定NSCLC患者是否能够应用和选择合适EGFR-TKI的先决条件。
EGFR突变类型
EGFR基因突变怎么测？
EGFR基因变异主要以点突变、插入/缺失为主，是DNA水平上的变异，临床上常用的检测方法有ARMS-PCR、NGS、dPCR、Sanger测序等。
利用组织标本进行EGFR突变检测是首选策略，当组织不可及时，可使用液体活检进行检测。对于这些已知基因突变，NGS能够同时对多基因、多位点进行测序，检测EGFR基因突变位点更加全面，可以发现罕见突变位点。NGS几乎能够全面覆盖EGFR ex20ins突变的不同亚型，而PCR检测对EGFR ex20ins突变亚型的漏检率高达50%，除此之外，相对序贯PCR检测，更节省样本，因此，推荐优先使用NGS作为EGFR基因的检测手段。
ARMS-PCR法，检测时间短且检测费用相对较低, 有成熟的商品化试剂盒，但通量低，只能检测已知的突变。dPCR是一种检测灵敏度高、特异性强的检测方法，可检测低至0.1％突变概率的突变, 除此之外，检测检测周期短，缺点也是通量低，只能检测已知的突变。Sanger测序法就类似于一个渔网，虽然可以同时捕获已知和未知突变，但只有目标鱼儿才能被捕获到, 临床上一、二代TKI耐药位点T790M常用Sanger测序。
EGFR检测的适用哪些人群？
[*]局部晚期或转移性NSCLC患者
[*]术后病理确诊IB期-IIIA期的NSCLC患者
[*]对一代/二代EGFR-TKI治疗进展的NSCLC患者
EGFR ex20ins阳性患者的治疗方案？
准确检出EGFR基因突变是NSCLC实施靶向治疗以及获益的前提。我们在考虑检测前，需要结合病情和临床诊治需求综合考虑进行基于EGFR突变状态指导个体化靶向治疗。
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